传统的试管婴儿技术需要使用大量的促排卵药物，而试管短效长方案只需少量的促排卵药物。再者导源于采用了自然周期或微刺激周期进行治疗，不需要频繁检测与调整药物剂量，减少了医疗费用和时间成本。试管短效长方案还能避免因过度刺激酿成多胞胎妊娠的风险。多胞胎妊娠会增加母亲和胎儿的健康风险，并增加产前监测与分娩的复杂性，由此推进增加了医疗费用和风险。所以试管短效长方案在花销上具有明显优势。成功率较高
试管短效长方案相对于其他方案，在成功率上也有一定的优势。
根源在于采用自然周期或微刺激周期进行治疗，更贴近自然生育过程，减少了对卵巢功能的干扰。连带地鉴于不使用大量促排卵药物，避免了过度刺激衍生出卵巢反应亢进和减少卵子质量的问题。试管短效长方案还能根据女性个体特点进行个体化调整，提高治疗的精确性和针对性。例如在选择胚胎移植时间时可以根据女性黄体期的情况进行调整，提高胚胎着床率。在成功率上试管短效长方案有较大潜力。操作难度低
相比于其他辅助生殖技术来说，试管短效长方案的操作难度较低。
传统的试管婴儿技术需要密集监测和频繁注射促排卵药物，而试管短效长方案只需较少的药物使用和检测过程。这减轻了患者的心理负担，也减少了治疗过程中的不适感。